De Vlaamse landbouwsector heeft een impact op de luchtkwaliteit, de menselijke gezondheid en de vitaliteit van vegetatie en ecosystemen door:
- de uitstoot van ammoniak (NH3), gerelateerd aan stallen, mestopslag, het toedienen van mest en mestverwerking, dat tevens leidt tot secundair fijn stof;
- de uitstoot van stikstofoxiden (NOx) en zwaveldioxide (SO2), gerelateerd aan verbrandingsemissies voor de verwarming van stallen en serres;
- de uitstoot van fijn stof afkomstig van stallen, van de uitlaatemissies van landbouwmachines en van opwaaiend stof door het bewerken van landbouwgronden;
- de uitstoot van stikstofmonoxide (NO) ten gevolge van mestopslag en het toedienen van mest;
- de uitstoot van niet-methaan vluchtige organische stoffen (NMVOS) door mest(opslag), gewasproductie en landbouwgronden;
- de uitstoot van methaan (CH4) afkomstig van de verteringsprocessen van rundvee en afkomstig van mestopslag;
- de uitstoot van distiksotfoxide (N2O) tijdens de productie en opslag van dierlijke mest, en door bodemprocessen als gevolg van stikstofbemesting (dierlijke mest/kunstmest).
Daarom neemt de Vlaamse overheid specifieke maatregelen voor de landbouw om de impact te verminderen.