Stikstofdioxide komt via de ademhaling in het lichaam. Zowel korte episodes van hoge concentraties als langdurige blootstelling aan lage concentraties (5 - 10 µg/m³) zijn schadelijk, ze veroorzaken:
- Irritaties van de luchtwegen.
- Astma bij kinderen.
- Stikstofoxiden dragen bij tot de vorming van ozon en fijn stof die ook schadelijke effecten hebben op de gezondheid.
In de natuur dragen stikstofoxides bij aan verzuring en vermesting:
- Stikstofdepositie vermindert de plantendiversiteit en maakt planten gevoeliger voor stress door bv. droogte en insecten.
- De kwaliteit van het grondwater daalt door uitspoeling van nitraat en metalen.